Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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