Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms