Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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