Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIP13Q15645 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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TRIP13Q15645 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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TRIP13Q15645 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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TRIP13Q15645 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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TRIP13Q15645 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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TRIP13Q15645 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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TRIP13Q15645 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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TRIP13Q15645 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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TRIP13Q15645 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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TRIP13Q15645 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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TRIP13Q15645 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms