Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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SEC23BQ15437 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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SEC23BQ15437 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SEC23BQ15437 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SEC23BQ15437 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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SEC23BQ15437 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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SEC23BQ15437 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms