Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRD3Q15059 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRD3Q15059 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRD3Q15059 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRD3Q15059 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BRD3Q15059 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRD3Q15059 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRD3Q15059 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRD3Q15059 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRD3Q15059 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRD3Q15059 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRD3Q15059 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRD3Q15059 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRD3Q15059 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRD3Q15059 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRD3Q15059 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRD3Q15059 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRD3Q15059 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD3Q15059 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRD3Q15059 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD3Q15059 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD3Q15059 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD3Q15059 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD3Q15059 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD3Q15059 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD3Q15059 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD3Q15059 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD3Q15059 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD3Q15059 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD3Q15059 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD3Q15059 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD3Q15059 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BRD3Q15059 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRD3Q15059 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD3Q15059 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD3Q15059 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRD3Q15059 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD3Q15059 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRD3Q15059 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRD3Q15059 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BRD3Q15059 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRD3Q15059 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRD3Q15059 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRD3Q15059 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRD3Q15059 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRD3Q15059 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRD3Q15059 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRD3Q15059 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRD3Q15059 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRD3Q15059 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRD3Q15059 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRD3Q15059 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRD3Q15059 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRD3Q15059 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRD3Q15059 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRD3Q15059 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRD3Q15059 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRD3Q15059 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRD3Q15059 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRD3Q15059 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRD3Q15059 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRD3Q15059 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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