Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC2Q13868 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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