Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 NSD2-223ENST00000513726 648 ntTSL 311.13□□□□□ -0.632e-9■□□□□ 9.7
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TRA2AQ13595 CHD2-225ENST00000636861 146 ntTSL 53.59□□□□□ -1.833e-13■□□□□ 9.7
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TRA2AQ13595 DNAJB1-205ENST00000595992 601 ntTSL 24.96□□□□□ -1.626e-13■□□□□ 9.7
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TRA2AQ13595 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.021e-6■□□□□ 9.6
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TRA2AQ13595 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.661e-27■□□□□ 9.5
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TRA2AQ13595 SNX5-214ENST00000490175 2025 ntTSL 1 (best)14.55□□□□□ -0.084e-10■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.194e-10■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SNX5-208ENST00000475716 715 ntTSL 310.02□□□□□ -0.814e-10■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SNX5-211ENST00000483485 3087 ntTSL 26.81□□□□□ -1.324e-10■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SNX5-216ENST00000494401 656 ntTSL 54.6□□□□□ -1.674e-10■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SNX5-207ENST00000474883 695 ntTSL 53.54□□□□□ -1.844e-10■□□□□ 9.5
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TRA2AQ13595 RPL41-204ENST00000546591 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.11e-7■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 RPL41-202ENST00000501597 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.281e-7■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 RPL41-203ENST00000546485 335 ntTSL 26.27□□□□□ -1.411e-7■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 RPL41-205ENST00000546654 238 ntTSL 25.8□□□□□ -1.481e-7■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.41■■□□□ 1.662e-37■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 DANCR-203ENST00000441504 336 ntTSL 217.42■□□□□ 0.382e-37■□□□□ 9.5
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