Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACACAQ13085 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms