Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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