Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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GTF3C1Q12789 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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GTF3C1Q12789 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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GTF3C1Q12789 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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GTF3C1Q12789 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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GTF3C1Q12789 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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GTF3C1Q12789 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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GTF3C1Q12789 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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GTF3C1Q12789 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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