Protein–RNA interactions for Protein: Q12420

SNU66, 66 kDa U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein component, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNU66Q12420 RPL42BYHR141C 321 nt1.72□□□□□ -2.13
SNU66Q12420 BSC3YLR465C 309 nt1.72□□□□□ -2.13
SNU66Q12420 RPL42AYNL162W 321 nt1.72□□□□□ -2.13
SNU66Q12420 YLR422WYLR422W 5799 nt1.71□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 SEF1YBL066C 3447 nt1.71□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 YGR265WYGR265W 411 nt1.71□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.71□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 PHS1YJL097W 654 nt1.71□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 ABM1YJR108W 372 nt1.71□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 YAR047CYAR047C 321 nt1.71□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 GIM4YEL003W 336 nt1.7□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 YGL239CYGL239C 315 nt1.7□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt1.7□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 RPL26AYLR344W 384 nt1.7□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 RPL32YBL092W 393 nt1.7□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 YBP1YBR216C 2025 nt1.69□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 SSK2YNR031C 4740 nt1.69□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 YAP6YDR259C 1152 nt1.69□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 CLU1YMR012W 3834 nt1.69□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 YDL011CYDL011C 324 nt1.68□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt1.68□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 HHT1YBR010W 411 nt1.68□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 PCF11YDR228C 1881 nt1.67□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 YJL015CYJL015C 285 nt1.67□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 HIT1YJR055W 495 nt1.67□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 YPL182CYPL182C 384 nt1.67□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 SPC110YDR356W 2835 nt1.67□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 OSH6YKR003W 1347 nt1.66□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 EMC5YIL027C 426 nt1.66□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 YCL046WYCL046W 324 nt1.66□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 MON2YNL297C 4911 nt1.66□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 MLH3YPL164C 2148 nt1.66□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 YGR130CYGR130C 2451 nt1.65□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 RKM1YPL208W 1752 nt1.65□□□□□ -2.14
SNU66Q12420 TOF2YKR010C 2316 nt1.65□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.65□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.65□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 YLR140WYLR140W 327 nt1.65□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 ISF1YMR081C 1017 nt1.65□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 RPL9BYNL067W 576 nt1.65□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 YNL114CYNL114C 372 nt1.65□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 YOR121CYOR121C 306 nt1.65□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 POL5YEL055C 3069 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 MSN5YDR335W 3675 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 TIM13YGR181W 318 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 PAU18YLL064C 363 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 PAU6YNR076W 363 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 EST2YLR318W 2655 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 SEC21YNL287W 2808 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 PIK1YNL267W 3201 nt1.63□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.63□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.63□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.63□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.63□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.63□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.63□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.63□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 YBR012CYBR012C 420 nt1.63□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 YBR174CYBR174C 315 nt1.63□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 MSH5YDL154W 2706 nt1.63□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 CCH1YGR217W 6120 nt1.63□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 YDR008CYDR008C 351 nt1.62□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 YKL083WYKL083W 615 nt1.62□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 PIP2YOR363C 2991 nt1.62□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 YJL022WYJL022W 309 nt1.61□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 VPS55YJR044C 423 nt1.61□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 ALK1YGL021W 2283 nt1.61□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 SWI5YDR146C 2130 nt1.6□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 COF1YLL050C 432 nt1.6□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.6□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 YOR029WYOR029W 336 nt1.6□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 PXA2YKL188C 2562 nt1.6□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 KAP122YGL016W 3246 nt1.59□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 MUK1YPL070W 1839 nt1.59□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 CDC25YLR310C 4770 nt1.59□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 SRP14YDL092W 441 nt1.59□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 YHL041WYHL041W 450 nt1.59□□□□□ -2.15
SNU66Q12420 HDA3YPR179C 1968 nt1.59□□□□□ -2.16
SNU66Q12420 SEC5YDR166C 2916 nt1.59□□□□□ -2.16
SNU66Q12420 AZF1YOR113W 2745 nt1.59□□□□□ -2.16
SNU66Q12420 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.58□□□□□ -2.16
SNU66Q12420 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.58□□□□□ -2.16
SNU66Q12420 YOR376WYOR376W 369 nt1.58□□□□□ -2.16
SNU66Q12420 ZRG17YNR039C 1818 nt1.58□□□□□ -2.16
SNU66Q12420 UFD2YDL190C 2886 nt1.58□□□□□ -2.16
SNU66Q12420 SEC3YER008C 4011 nt1.57□□□□□ -2.16
SNU66Q12420 MVP1YMR004W 1536 nt1.57□□□□□ -2.16
SNU66Q12420 AIM9YER080W 1884 nt1.57□□□□□ -2.16
SNU66Q12420 CYC7YEL039C 342 nt1.57□□□□□ -2.16
SNU66Q12420 RPS27AYKL156W 249 nt1.57□□□□□ -2.16
SNU66Q12420 YCS4YLR272C 3531 nt1.57□□□□□ -2.16
SNU66Q12420 LAA1YJL207C 6045 nt1.57□□□□□ -2.16
SNU66Q12420 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.57□□□□□ -2.16
SNU66Q12420 YLL054CYLL054C 2532 nt1.57□□□□□ -2.16
SNU66Q12420 SPC98YNL126W 2541 nt1.57□□□□□ -2.16
SNU66Q12420 PAC1YOR269W 1485 nt1.56□□□□□ -2.16
SNU66Q12420 RSM22YKL155C 1887 nt1.56□□□□□ -2.16
SNU66Q12420 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.56□□□□□ -2.16
SNU66Q12420 YML003WYML003W 873 nt1.56□□□□□ -2.16
SNU66Q12420 IRC23YOR044W 474 nt1.56□□□□□ -2.16
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