Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.47□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt1.47□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 SSK2YNR031C 4740 nt1.47□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 PET127YOR017W 2403 nt1.47□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 YDL011CYDL011C 324 nt1.46□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.46□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 YHL037CYHL037C 402 nt1.46□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 RLM1YPL089C 2031 nt1.45□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 CAT8YMR280C 4302 nt1.45□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 HMRA1YCR097W 381 nt1.45□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 ISF1YMR081C 1017 nt1.45□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.45□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 TOF2YKR010C 2316 nt1.45□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 KIP1YBL063W 3336 nt1.45□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.44□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 ABM1YJR108W 372 nt1.44□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 YLR334CYLR334C 381 nt1.44□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 IRR1YIL026C 3453 nt1.43□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 NUP192YJL039C 5052 nt1.43□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.43□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.43□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 YPL182CYPL182C 384 nt1.43□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 YPR012WYPR012W 255 nt1.43□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 PXA2YKL188C 2562 nt1.43□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 PCF11YDR228C 1881 nt1.42□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 TIM13YGR181W 318 nt1.42□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 YAR047CYAR047C 321 nt1.42□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 HKR1YDR420W 5409 nt1.42□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 NCA2YPR155C 1851 nt1.41□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 SFB2YNL049C 2631 nt1.41□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 FYV8YGR196C 2454 nt1.41□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 SRP14YDL092W 441 nt1.41□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.41□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 ANS1YHR126C 480 nt1.41□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 PMD1YER132C 5262 nt1.41□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 YLR422WYLR422W 5799 nt1.41□□□□□ -2.18
LDB17Q12342 CDC25YLR310C 4770 nt1.4□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 HDA3YPR179C 1968 nt1.4□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 YJL015CYJL015C 285 nt1.4□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 YLR140WYLR140W 327 nt1.4□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 YML003WYML003W 873 nt1.4□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 RPL9BYNL067W 576 nt1.4□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 FMP23YBR047W 528 nt1.4□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 YPL261CYPL261C 309 nt1.4□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 MVP1YMR004W 1536 nt1.4□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 SEC21YNL287W 2808 nt1.39□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 SWI5YDR146C 2130 nt1.39□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 YOR121CYOR121C 306 nt1.39□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt1.39□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 PIK1YNL267W 3201 nt1.39□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 MSH5YDL154W 2706 nt1.38□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 YHL041WYHL041W 450 nt1.38□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 YKL083WYKL083W 615 nt1.38□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 YOP1YPR028W 543 nt1.38□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 TRM732YMR259C 4263 nt1.38□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 ZRG17YNR039C 1818 nt1.38□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 MSN5YDR335W 3675 nt1.37□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 EST2YLR318W 2655 nt1.37□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 CYC7YEL039C 342 nt1.37□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 HIT1YJR055W 495 nt1.37□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 MLH3YPL164C 2148 nt1.37□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 KAP122YGL016W 3246 nt1.36□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 snR56snR56 88 nt1.36□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 AIM9YER080W 1884 nt1.36□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 YJL022WYJL022W 309 nt1.36□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 LYS14YDR034C 2373 nt1.36□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 PAC1YOR269W 1485 nt1.36□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 ALK1YGL021W 2283 nt1.35□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 RTR1YER139C 681 nt1.35□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 YGR265WYGR265W 411 nt1.35□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.35□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 COF1YLL050C 432 nt1.35□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 YBL073WYBL073W 312 nt1.35□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 HHT1YBR010W 411 nt1.35□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 MAK10YEL053C 2202 nt1.35□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 GIM4YEL003W 336 nt1.34□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.34□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.34□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.34□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.34□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.34□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.34□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.34□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.34□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 UPS1YLR193C 528 nt1.34□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 YBR012CYBR012C 420 nt1.34□□□□□ -2.19
LDB17Q12342 RSM22YKL155C 1887 nt1.33□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 AHC1YOR023C 1701 nt1.33□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 CSN9YDR179C 489 nt1.33□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt1.33□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 YPL229WYPL229W 621 nt1.33□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 NUT2YPR168W 474 nt1.33□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 SEC5YDR166C 2916 nt1.33□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 MAD1YGL086W 2250 nt1.33□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 SMC4YLR086W 4257 nt1.32□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.32□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt1.32□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 VPS55YJR044C 423 nt1.32□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 MSH3YCR092C 3057 nt1.32□□□□□ -2.2
LDB17Q12342 DCP2YNL118C 2913 nt1.32□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.6 ms