Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.4 ms