Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms