Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB4BP68371 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBB4BP68371 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TUBB4BP68371 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TUBB4BP68371 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBB4BP68371 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBB4BP68371 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TUBB4BP68371 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TUBB4BP68371 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TUBB4BP68371 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TUBB4BP68371 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB4BP68371 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB4BP68371 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB4BP68371 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB4BP68371 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB4BP68371 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB4BP68371 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TUBB4BP68371 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB4BP68371 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB4BP68371 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB4BP68371 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB4BP68371 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB4BP68371 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB4BP68371 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB4BP68371 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB4BP68371 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB4BP68371 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB4BP68371 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB4BP68371 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms