Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL23P62829 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL23P62829 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL23P62829 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL23P62829 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL23P62829 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL23P62829 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL23P62829 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL23P62829 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL23P62829 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL23P62829 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL23P62829 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL23P62829 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL23P62829 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL23P62829 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL23P62829 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL23P62829 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL23P62829 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL23P62829 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL23P62829 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL23P62829 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL23P62829 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL23P62829 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL23P62829 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL23P62829 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL23P62829 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL23P62829 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL23P62829 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL23P62829 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL23P62829 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL23P62829 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL23P62829 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL23P62829 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL23P62829 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL23P62829 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL23P62829 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL23P62829 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL23P62829 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms