Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTBP60709 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTBP60709 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTBP60709 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTBP60709 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTBP60709 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTBP60709 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTBP60709 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTBP60709 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTBP60709 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTBP60709 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTBP60709 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTBP60709 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTBP60709 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTBP60709 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTBP60709 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTBP60709 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTBP60709 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTBP60709 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTBP60709 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTBP60709 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTBP60709 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTBP60709 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTBP60709 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTBP60709 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTBP60709 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTBP60709 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTBP60709 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTBP60709 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTBP60709 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTBP60709 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTBP60709 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTBP60709 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTBP60709 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTBP60709 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTBP60709 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTBP60709 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTBP60709 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTBP60709 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTBP60709 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTBP60709 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTBP60709 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTBP60709 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTBP60709 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTBP60709 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTBP60709 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTBP60709 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTBP60709 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTBP60709 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms