Protein–RNA interactions for Protein: P54132

BLM, Bloom syndrome protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLMP54132 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BLMP54132 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BLMP54132 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BLMP54132 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BLMP54132 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BLMP54132 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BLMP54132 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BLMP54132 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BLMP54132 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BLMP54132 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BLMP54132 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BLMP54132 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BLMP54132 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BLMP54132 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BLMP54132 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BLMP54132 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BLMP54132 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BLMP54132 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BLMP54132 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BLMP54132 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BLMP54132 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BLMP54132 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BLMP54132 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BLMP54132 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BLMP54132 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BLMP54132 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BLMP54132 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BLMP54132 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BLMP54132 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BLMP54132 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BLMP54132 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BLMP54132 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BLMP54132 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BLMP54132 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BLMP54132 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLMP54132 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLMP54132 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLMP54132 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLMP54132 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BLMP54132 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLMP54132 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLMP54132 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLMP54132 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BLMP54132 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLMP54132 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLMP54132 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLMP54132 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLMP54132 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLMP54132 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLMP54132 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLMP54132 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BLMP54132 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BLMP54132 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BLMP54132 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BLMP54132 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BLMP54132 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BLMP54132 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BLMP54132 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BLMP54132 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BLMP54132 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BLMP54132 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BLMP54132 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BLMP54132 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BLMP54132 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
BLMP54132 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
BLMP54132 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BLMP54132 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BLMP54132 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BLMP54132 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BLMP54132 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BLMP54132 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BLMP54132 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BLMP54132 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BLMP54132 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BLMP54132 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BLMP54132 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BLMP54132 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BLMP54132 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BLMP54132 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BLMP54132 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BLMP54132 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BLMP54132 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BLMP54132 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BLMP54132 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BLMP54132 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BLMP54132 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BLMP54132 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BLMP54132 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BLMP54132 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BLMP54132 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BLMP54132 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BLMP54132 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BLMP54132 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BLMP54132 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BLMP54132 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BLMP54132 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BLMP54132 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BLMP54132 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BLMP54132 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BLMP54132 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms