Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LMAN1P49257 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LMAN1P49257 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LMAN1P49257 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
LMAN1P49257 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LMAN1P49257 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LMAN1P49257 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LMAN1P49257 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
LMAN1P49257 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LMAN1P49257 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN1P49257 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN1P49257 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN1P49257 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN1P49257 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN1P49257 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN1P49257 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN1P49257 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN1P49257 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN1P49257 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN1P49257 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN1P49257 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LMAN1P49257 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN1P49257 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN1P49257 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN1P49257 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN1P49257 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN1P49257 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN1P49257 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN1P49257 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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