Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms