Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 BEM2YER155C 6504 nt1.2□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 YER135CYER135C 393 nt1.2□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 URM1YIL008W 300 nt1.2□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 AIM29YKR074W 468 nt1.2□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 FYV7YLR068W 456 nt1.2□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt1.2□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 CLU1YMR012W 3834 nt1.19□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 SPT7YBR081C 3999 nt1.19□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 SRP14YDL092W 441 nt1.19□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.19□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 YGR045CYGR045C 363 nt1.19□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 RPL40BYKR094C 387 nt1.19□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt1.19□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 TIM18YOR297C 579 nt1.19□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt1.19□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 YLL054CYLL054C 2532 nt1.19□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 PAU2YEL049W 363 nt1.18□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.18□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 CDC33YOL139C 642 nt1.18□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 YOP1YPR028W 543 nt1.18□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 YSY6YBR162W-A 198 nt1.18□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 SEC3YER008C 4011 nt1.18□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.17□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 YDR008CYDR008C 351 nt1.17□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 YGL217CYGL217C 342 nt1.17□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 HCH1YNL281W 462 nt1.17□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 YPR063CYPR063C 423 nt1.17□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 SWI6YLR182W 2412 nt1.17□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 COG4YPR105C 2586 nt1.16□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 BI2Q0110 1272 nt1.16□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 ECL1YGR146C 636 nt1.16□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.16□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 GAL7YBR018C 1101 nt1.16□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 SLX4YLR135W 2247 nt1.16□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 SGO1YOR073W 1773 nt1.16□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 YLR171WYLR171W 390 nt1.15□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 RPL9BYNL067W 576 nt1.15□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 GDS1YOR355W 1569 nt1.15□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 MKT1YNL085W 2493 nt1.15□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 NST1YNL091W 3723 nt1.14□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 YDL211CYDL211C 1119 nt1.14□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt1.14□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 YER076W-AYER076W-A 348 nt1.14□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 YGL239CYGL239C 315 nt1.14□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.14□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 YOR029WYOR029W 336 nt1.14□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 snR41snR41 95 nt1.14□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 snR54snR54 86 nt1.14□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 YCS4YLR272C 3531 nt1.14□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 VPS54YDR027C 2670 nt1.13□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 LYS14YDR034C 2373 nt1.13□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 YDR114CYDR114C 303 nt1.13□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 PHS1YJL097W 654 nt1.13□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 TOM22YNL131W 459 nt1.13□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 RPL32YBL092W 393 nt1.13□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 APL1YJR005W 2103 nt1.12□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.12□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.12□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 RPL34BYIL052C 366 nt1.12□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 NFU1YKL040C 771 nt1.12□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 RPS27AYKL156W 249 nt1.12□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 SPO23YBR250W 1572 nt1.12□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 NOC3YLR002C 1992 nt1.12□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.12□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 RUF22RUF22 515 nt1.11□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 NUP145YGL092W 3954 nt1.11□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 PIG1YLR273C 1947 nt1.11□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 ROM2YLR371W 4071 nt1.1□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.1□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 YLL020CYLL020C 306 nt1.1□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 ZEO1YOL109W 342 nt1.1□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 VAM6YDL077C 3150 nt1.1□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 NUP188YML103C 4968 nt1.09□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 HIT1YJR055W 495 nt1.09□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 YPL182CYPL182C 384 nt1.09□□□□□ -2.23
SHQ1P40486 PAC1YOR269W 1485 nt1.09□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 MDS3YGL197W 4464 nt1.09□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 SAS3YBL052C 2496 nt1.09□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 PXA2YKL188C 2562 nt1.08□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 YAR009CYAR009C 3591 nt1.08□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 YER006C-AYER006C-A 318 nt1.08□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 RTR1YER139C 681 nt1.08□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 YBL071CYBL071C 309 nt1.08□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 ATP19YOL077W-A 207 nt1.08□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt1.08□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 EFR3YMR212C 2349 nt1.07□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 BUD3YCL014W 4911 nt1.07□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 SPT21YMR179W 2277 nt1.07□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 YIL059CYIL059C 366 nt1.07□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 YLR101CYLR101C 396 nt1.07□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 YLR287CYLR287C 1068 nt1.07□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 UBP3YER151C 2739 nt1.07□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 SWI4YER111C 3282 nt1.07□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 SCC2YDR180W 4482 nt1.07□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 TIM13YGR181W 318 nt1.06□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 PAM16YJL104W 450 nt1.06□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 SDH2YLL041C 801 nt1.06□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.06□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 NUT2YPR168W 474 nt1.06□□□□□ -2.24
SHQ1P40486 AIM44YPL158C 2277 nt1.06□□□□□ -2.24
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