Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGFBR1P36897 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms