Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTN2P35609 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms