Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHRNA5P30532 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA5P30532 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms