Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRR1P24046 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABRR1P24046 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABRR1P24046 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GABRR1P24046 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABRR1P24046 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABRR1P24046 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms