Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRGP23470 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
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