Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
S100A1P23297 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
S100A1P23297 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
S100A1P23297 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
S100A1P23297 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
S100A1P23297 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
S100A1P23297 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
S100A1P23297 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
S100A1P23297 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
S100A1P23297 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
S100A1P23297 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
S100A1P23297 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
S100A1P23297 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
S100A1P23297 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
S100A1P23297 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
S100A1P23297 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
S100A1P23297 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
S100A1P23297 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
S100A1P23297 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
S100A1P23297 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
S100A1P23297 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
S100A1P23297 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
S100A1P23297 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
S100A1P23297 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
S100A1P23297 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
S100A1P23297 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17■□□□□ 0.31
S100A1P23297 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
S100A1P23297 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
S100A1P23297 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
S100A1P23297 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
S100A1P23297 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
S100A1P23297 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
S100A1P23297 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
S100A1P23297 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
S100A1P23297 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
S100A1P23297 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
S100A1P23297 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
S100A1P23297 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
S100A1P23297 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
S100A1P23297 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
S100A1P23297 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
S100A1P23297 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
S100A1P23297 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
S100A1P23297 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
S100A1P23297 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
S100A1P23297 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
S100A1P23297 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms