Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XBP1P17861 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XBP1P17861 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XBP1P17861 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XBP1P17861 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XBP1P17861 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XBP1P17861 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XBP1P17861 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XBP1P17861 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XBP1P17861 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XBP1P17861 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XBP1P17861 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XBP1P17861 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XBP1P17861 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XBP1P17861 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XBP1P17861 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XBP1P17861 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XBP1P17861 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XBP1P17861 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
XBP1P17861 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XBP1P17861 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XBP1P17861 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XBP1P17861 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XBP1P17861 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XBP1P17861 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
XBP1P17861 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
XBP1P17861 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XBP1P17861 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XBP1P17861 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XBP1P17861 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XBP1P17861 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XBP1P17861 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XBP1P17861 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XBP1P17861 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XBP1P17861 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XBP1P17861 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XBP1P17861 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XBP1P17861 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XBP1P17861 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XBP1P17861 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XBP1P17861 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XBP1P17861 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XBP1P17861 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XBP1P17861 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XBP1P17861 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XBP1P17861 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XBP1P17861 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
XBP1P17861 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
XBP1P17861 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
XBP1P17861 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XBP1P17861 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
XBP1P17861 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XBP1P17861 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XBP1P17861 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XBP1P17861 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XBP1P17861 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XBP1P17861 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XBP1P17861 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XBP1P17861 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XBP1P17861 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XBP1P17861 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XBP1P17861 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XBP1P17861 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XBP1P17861 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XBP1P17861 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XBP1P17861 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XBP1P17861 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XBP1P17861 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XBP1P17861 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XBP1P17861 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XBP1P17861 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XBP1P17861 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XBP1P17861 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XBP1P17861 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XBP1P17861 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XBP1P17861 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XBP1P17861 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XBP1P17861 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
XBP1P17861 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
XBP1P17861 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XBP1P17861 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms