Protein–RNA interactions for Protein: P16562

CRISP2, Cysteine-rich secretory protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP2P16562 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRISP2P16562 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP2P16562 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms