Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RGPD2P0DJD1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGPD2P0DJD1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms