Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	ZRG17	YNR039C	1818 nt		0.76	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	NUP188	YML103C	4968 nt		0.76	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	BIG1	YHR101C	1008 nt		0.76	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	PHS1	YJL097W	654 nt		0.76	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	TMA22	YJR014W	597 nt		0.76	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	VPS55	YJR044C	423 nt		0.76	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	NFU1	YKL040C	771 nt		0.76	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	YML108W	YML108W	318 nt		0.76	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	YMR242W-A	YMR242W-A	90 nt		0.76	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	FMP23	YBR047W	528 nt		0.76	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	LOA1	YPR139C	903 nt		0.76	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	DGR2	YKL121W	2559 nt		0.76	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	PAU2	YEL049W	363 nt		0.75	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	URM1	YIL008W	300 nt		0.75	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	YNL122C	YNL122C	348 nt		0.75	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	RPL32	YBL092W	393 nt		0.75	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	YOP1	YPR028W	543 nt		0.75	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	SEC5	YDR166C	2916 nt		0.75	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	HDA3	YPR179C	1968 nt		0.75	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	ROM2	YLR371W	4071 nt		0.75	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	HMLALPHA2	YCL067C	633 nt		0.74	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	MATALPHA2	YCR039C	633 nt		0.74	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	MXR1	YER042W	555 nt		0.74	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	YGL217C	YGL217C	342 nt		0.74	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	RPL16A	YIL133C	600 nt		0.74	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	HHT1	YBR010W	411 nt		0.74	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	MYO1	YHR023W	5787 nt		0.74	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	DOP1	YDR141C	5097 nt		0.74	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	EAF1	YDR359C	2949 nt		0.74	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	SLX4	YLR135W	2247 nt		0.73	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	SEC3	YER008C	4011 nt		0.73	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	YDR008C	YDR008C	351 nt		0.73	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	RTR1	YER139C	681 nt		0.73	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	NBL1	YHR199C-A	222 nt		0.73	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	YMR141W-A	YMR141W-A	225 nt		0.73	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	YMR153C-A	YMR153C-A	336 nt		0.73	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	HCH1	YNL281W	462 nt		0.73	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	snR41	snR41	95 nt		0.73	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	MAK10	YEL053C	2202 nt		0.73	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	AI5_ALPHA	Q0070	1893 nt		0.73	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	GDS1	YOR355W	1569 nt		0.72	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	YGR265W	YGR265W	411 nt		0.72	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	RPL40B	YKR094C	387 nt		0.72	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	SDH2	YLL041C	801 nt		0.72	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	RUF22	RUF22	515 nt		0.72	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	ERP4	YOR016C	624 nt		0.72	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	YOR376W	YOR376W	369 nt		0.72	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	TOF2	YKR010C	2316 nt		0.72	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	NUP120	YKL057C	3114 nt		0.72	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	KAP120	YPL125W	3099 nt		0.72	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	SAS3	YBL052C	2496 nt		0.72	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	MKT1	YNL085W	2493 nt		0.72	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	PXA2	YKL188C	2562 nt		0.71	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	YDL211C	YDL211C	1119 nt		0.71	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	WIP1	YDR374W-A	270 nt		0.71	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	BI2	Q0110	1272 nt		0.71	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	YML009C-A	YML009C-A	327 nt		0.71	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	TIM18	YOR297C	579 nt		0.71	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	ATP19	YOL077W-A	207 nt		0.7	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	ZIP1	YDR285W	2628 nt		0.7	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	LYS14	YDR034C	2373 nt		0.69	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	YDR182W-A	YDR182W-A	204 nt		0.69	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	CYC7	YEL039C	342 nt		0.69	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	YHL009W-A	YHL009W-A	1242 nt		0.69	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	YIL066W-A	YIL066W-A	444 nt		0.69	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	YBL073W	YBL073W	312 nt		0.69	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	ZEO1	YOL109W	342 nt		0.69	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	NUT2	YPR168W	474 nt		0.69	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	SPO23	YBR250W	1572 nt		0.69	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	PIP2	YOR363C	2991 nt		0.68	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	YGL239C	YGL239C	315 nt		0.68	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	RTT102	YGR275W	474 nt		0.68	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	YHR125W	YHR125W	306 nt		0.68	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	YHR130C	YHR130C	336 nt		0.68	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	EMC5	YIL027C	426 nt		0.68	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	YLR171W	YLR171W	390 nt		0.68	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	YAR009C	YAR009C	3591 nt		0.68	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	CDC39	YCR093W	6327 nt		0.68	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	SGO1	YOR073W	1773 nt		0.68	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	YER087C-A	YER087C-A	552 nt		0.67	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	YBL071C	YBL071C	309 nt		0.67	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	YOL013W-B	YOL013W-B	291 nt		0.67	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	PAU24	YBR301W	363 nt		0.67	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	UBP3	YER151C	2739 nt		0.67	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	MRPL31	YKL138C	396 nt		0.66	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	YLL020C	YLL020C	306 nt		0.66	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	YLR101C	YLR101C	396 nt		0.66	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	YLR287C	YLR287C	1068 nt		0.66	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	UBC7	YMR022W	498 nt		0.66	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	YMR175W-A	YMR175W-A	195 nt		0.66	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	RPL9B	YNL067W	576 nt		0.66	□□□□□ -2.3
VAR1	P02381	CBS1	YDL069C	690 nt		0.65	□□□□□ -2.31
VAR1	P02381	YER076W-A	YER076W-A	348 nt		0.65	□□□□□ -2.31
VAR1	P02381	HIT1	YJR055W	495 nt		0.65	□□□□□ -2.31
VAR1	P02381	YLR146W-A	YLR146W-A	189 nt		0.65	□□□□□ -2.31
VAR1	P02381	snR54	snR54	86 nt		0.65	□□□□□ -2.31
VAR1	P02381	YLL032C	YLL032C	2478 nt		0.65	□□□□□ -2.31
VAR1	P02381	PIG1	YLR273C	1947 nt		0.65	□□□□□ -2.31
VAR1	P02381	SLD3	YGL113W	2007 nt		0.65	□□□□□ -2.31
VAR1	P02381	SCW11	YGL028C	1629 nt		0.64	□□□□□ -2.31

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