Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNTO95613 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNTO95613 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNTO95613 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNTO95613 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNTO95613 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNTO95613 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNTO95613 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNTO95613 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNTO95613 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNTO95613 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNTO95613 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNTO95613 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNTO95613 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNTO95613 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNTO95613 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNTO95613 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNTO95613 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNTO95613 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNTO95613 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNTO95613 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNTO95613 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNTO95613 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNTO95613 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNTO95613 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNTO95613 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNTO95613 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNTO95613 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNTO95613 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNTO95613 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNTO95613 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNTO95613 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNTO95613 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNTO95613 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNTO95613 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNTO95613 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNTO95613 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNTO95613 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNTO95613 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNTO95613 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNTO95613 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNTO95613 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNTO95613 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNTO95613 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNTO95613 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNTO95613 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNTO95613 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNTO95613 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNTO95613 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNTO95613 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNTO95613 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNTO95613 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNTO95613 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNTO95613 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCNTO95613 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCNTO95613 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCNTO95613 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCNTO95613 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCNTO95613 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNTO95613 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNTO95613 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNTO95613 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNTO95613 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNTO95613 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNTO95613 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNTO95613 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNTO95613 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNTO95613 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNTO95613 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNTO95613 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNTO95613 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNTO95613 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNTO95613 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNTO95613 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNTO95613 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms