Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KIAA0556O60303 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC32■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC32■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC32■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms