Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SYNJ1O43426 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SYNJ1O43426 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms