Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QQQ9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QQQ9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QQQ9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QQQ9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QQQ9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QQQ9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QQQ9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QQQ9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QQQ9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
J3QQQ9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
J3QQQ9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
J3QQQ9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
J3QQQ9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QQQ9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QQQ9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QQQ9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QQQ9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QQQ9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QQQ9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QQQ9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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J3QQQ9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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J3QQQ9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QQQ9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QQQ9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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J3QQQ9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QQQ9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QQQ9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QQQ9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QQQ9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QQQ9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QQQ9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QQQ9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QQQ9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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J3QQQ9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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J3QQQ9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3QQQ9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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J3QQQ9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3QQQ9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3QQQ9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3QQQ9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3QQQ9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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J3QQQ9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3QQQ9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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J3QQQ9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3QQQ9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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J3QQQ9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3QQQ9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3QQQ9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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J3QQQ9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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J3QQQ9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3QQQ9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3QQQ9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3QQQ9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
J3QQQ9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3QQQ9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3QQQ9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3QQQ9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3QQQ9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3QQQ9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3QQQ9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3QQQ9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3QQQ9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3QQQ9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
J3QQQ9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
J3QQQ9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
J3QQQ9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
J3QQQ9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
J3QQQ9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
J3QQQ9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
J3QQQ9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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