Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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