Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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ARL2-SNX15V9GYD0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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ARL2-SNX15V9GYD0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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ARL2-SNX15V9GYD0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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ARL2-SNX15V9GYD0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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ARL2-SNX15V9GYD0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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ARL2-SNX15V9GYD0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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