Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F7

CDY2A, Testis-specific chromodomain protein Y 2, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY2AQ9Y6F7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDY2AQ9Y6F7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDY2AQ9Y6F7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms