Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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SH3BP1Q9Y3L3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
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SH3BP1Q9Y3L3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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SH3BP1Q9Y3L3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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SH3BP1Q9Y3L3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
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SH3BP1Q9Y3L3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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