Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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