Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms