Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms