Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms