Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms