Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PHRF1Q9P1Y6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms