Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms