Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4BQ9NT99 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms