Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms