Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms